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于吉人西醫(yī)綜合筆記—生物化學(xué)


Chaper 5 脂代謝
類(lèi)脂:固醇,酯,磷脂及糖酯
甘油三酯: 分解
一、甘油三酯的合成與分解
(一)分解,甘油三酯 甘油三酯脂肪E(關(guān)鍵E) 甘油+脂肪酸
該脂肪酶:激素敏感的脂肪酶,易受激素調(diào)節(jié),如腎上腺素緊張


Chaper 6   生物氧化
有關(guān)能量的來(lái)源途徑:(1)底物水平磷酸化,直接將代謝分子中的能量轉(zhuǎn)移至ADP(GGDP),生成ATP(GDP),三步反應(yīng);(2)氧化磷酸化,提供能量更多.
一、氧化磷酸化:代謝物經(jīng)氧化分解釋放能量,從而偶聯(lián)ADP磷酸化,產(chǎn)生ATP,電勢(shì)能-化學(xué)能
1、呼吸鏈的排列順序
2、兩條呼吸鏈的組成
3、糖耦聯(lián)磷酸化部位
4、P/0比值;消耗P和O的比值,即生成ATP摩爾數(shù);NADH:P/0=3 FADH:P/0=2
5、氯化磷酸化的調(diào)節(jié),ADP/ATP 下降時(shí),ATP多,氯化磷酸化減強(qiáng)
二、ATP能量?jī)?chǔ)存,轉(zhuǎn)運(yùn)的樞紐,GTP、UTP、CTP能量都來(lái)自ATP
磷酸肌酶可以作為主能化合物,是能量的一種儲(chǔ)存形式,但不能直接供能,磷酸肌酸提供
磷酸烯醇式丙酮酸:乙酰磷酸,乙酰COA
DATP DGTP DUTP DCTP不能放能,故不是分解化合物


Chephter 7 氨基酸代謝
一、一般代謝:指AA的脫氨基作用。少量的脫羧可以生成有活性的物質(zhì)。
1、方式:(1)谷aa脫H酶,(2)轉(zhuǎn)氯基
轉(zhuǎn)氨基作用(1)只滲入氨量的轉(zhuǎn)移,不滲及脫落
(2)轉(zhuǎn)氨酶的輔E是磷磷吡哆醛(胺)由VitB6轉(zhuǎn)化而來(lái)。
因此,脫氨基作用多為聯(lián)合脫氨基,方式有兩種,(1)肝、腎、腦中L-谷aa
氧化脫氨基作用(2)心肌骨骼肌中是嘌呤核苷酸酸循環(huán)。
2、產(chǎn)物有a酮酸和NH3兩種(1)a酮酸的代謝(1)再NH3化,生成相應(yīng)aa
(2)轉(zhuǎn)變?yōu)槠渌镔|(zhì):糖和酮體,即分為生糖aa,生酮aa,生糖兼生酮aa,包含有
例:丙aa(生糖aa)聯(lián)合脫氨丙酮酸丙酮激ECHCOCOA酮體(理論上可以生成)
(3)可以氯化分解供能,可以提供ATP
aa可以生成脂肪和糖
糖可以部分轉(zhuǎn)化為aa,除外必須aa以食物供給,亮亮頡色,苯蛋賴(lài)蘇,食物的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值取決于必需的種量和數(shù)量。
(2)NH3的代謝
1、來(lái)源(1)aa的脫氨基(主要來(lái)源)(2)從腸道而來(lái)NH3+H+ →NM4++OH-→吸收入血氨(3)腎小管上皮細(xì)胞:谷氨酰胺酶(肝硬化的血氨病人,洗腸時(shí)用酸性物質(zhì))
2、運(yùn)輸:(1)谷氨酰胺的形式:谷a+MH3→谷氨酰胺→腎 、矸臟
(2)葡萄糖丙aa循環(huán) NH3+丙酮酸→丙氨酸→MH3+丙酮酸
3、尿素合成-鳥(niǎo)氨酸循環(huán)
(1)部位:肝臟線(xiàn)粒體
(2)2個(gè)N:1個(gè)N來(lái)源于NH3,另一個(gè)N來(lái)源于天冬氨酸
(3)3個(gè)產(chǎn)物:瓜aa鳥(niǎo)aa不是組成pr的aa
二、個(gè)別aa代謝,
(一)脫羧作用:谷aa CO2一氨基丁酸 色
(二)一碳單位:1、概念:某些aa在分解代謝中可以產(chǎn)生含有一個(gè)碳原子的基因,
2、CO2不是一碳單位,碳單位載體是四氫葉酸
3、一碳單位的來(lái)源:絲色組甘(施舍一根竹竿)參加四清運(yùn)動(dòng)
4、一碳單位可以相互轉(zhuǎn)變
5、作用:嘌吟,嘧啶的合成原料,故一碳單位是氨基酸和核酸代謝聯(lián)系的樞紐。
三大物質(zhì)代謝的樞紐是:CH3COTCOA,G6P是糖代謝合成,分解,磷酸糖途徑,糖異生不同轉(zhuǎn)化方式的聯(lián)系樞紐。
(三)含硫aa的代謝
1、半胱aa→PAPS:機(jī)體內(nèi)SO42-的供體
2、蛋aa在腺苷轉(zhuǎn)移作用E下→SAM(S-腺苷蛋AA) →活性甲基的供體
(四)芳香族aa
苯丙氨酸缺乏引起苯酮的尿癥


Chapter 8 核苷酸代謝 合成為重點(diǎn)
1、不是營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),無(wú)營(yíng)養(yǎng)核酸之說(shuō),不要看過(guò)程,記住重要的點(diǎn)
一、分類(lèi)
從頭
合成
嘧啶核酸 補(bǔ)救
分解
核糖粒甘酸
核甘酸
脫氯糖甘酸
AMP(GMP)→DAMP,ADP→DADP, ATP→DATP
從核糖甘的轉(zhuǎn)變?yōu)槊撀群烁实氖窃诙椎乃缴线M(jìn)行的,抗代謝物是誰(shuí)的類(lèi)似物?它們抗代謝的生化機(jī)制是什么?
嘌吟核苷酸代謝的分解產(chǎn)物是尿酸(沉淀在關(guān)節(jié),它一沉淀積便提供損傷關(guān)節(jié)引起痛癥,治療藥物為別嘌吟醇,它能抑制黃嘌吟氧化酶的活性從而使尿酸生成減少)。
(二)嘧啶核甘酸的代謝產(chǎn)物:β-丙氨酸,由胞嘧啶分解生成的。(抗代謝物易出大題,抗代謝的代謝機(jī)理是什么?)


Chapter 9 DNA的生物合成
一、DNA的復(fù)制:
(一)過(guò)程:1、需要的酶:解鏈酶
2、單鏈DNA結(jié)合Pr
3、引物酶合成引物RNA,故是DNA指導(dǎo)的RNA聚合E
4、DNA聚合酶 5、RNA酶/核糖核酸E,水解掉RNA
6、DNA連接酶,連接起來(lái)
考點(diǎn):1、酶作用的順序,2、因子,E參與了DNA的復(fù)制
(二)特點(diǎn):(1)半保留復(fù)制(2)合成方向5端→3端(3)模板DNA(4)主要E是DNA聚合酶,(5)什么依賴(lài)(指導(dǎo))的XXE(6)原料:DNTP(7)產(chǎn)物DNA (8)DNA合成都需要引物,RNA合成都不需要引物。引物是為了在糖位原子上提供一個(gè)羥基,(8)衰老的端區(qū)學(xué)說(shuō)合成一點(diǎn),減少一點(diǎn)(不衰老CELL存在端粒酶,故DNA鏈不縮短,故cell不死亡),端粒酶(1)組成:蛋白質(zhì)+RNA(2)本質(zhì):以RNA為模板合成DNA,故是遞轉(zhuǎn)錄過(guò)程(3)存在于增殖旺盛的組織里面,如腫瘤CELL,骨髓干細(xì)胞分化較低,端區(qū)是一個(gè)重復(fù)序列。
二、逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程,以MRNA為模板,在遞轉(zhuǎn)錄酶的作用下,利于DNTP為原料,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則,合成DNA的過(guò)程。
逆轉(zhuǎn)錄E是:1、RNA 指導(dǎo)的DNA聚合酶
2、合成的互補(bǔ)鏈DNA稱(chēng)為CDNA
3、CDNA文庫(kù),包含了MRNA的信息:
4、作用:臨床上應(yīng)用
5、合成CDNA意義:(1)MRNA易于衰老,半衰期短(2)空氣中有解離MRNA的E
三、DNAM提供修復(fù),切除一修復(fù)
1、催化DNA合成復(fù)制的酶是:DNA-polI、II、III
2、損傷修復(fù)的酶主要是DNA聚合酶I
線(xiàn)粒體中 DNA的復(fù)制的酶:DNA-polr
四、原核、真粒生物DNA復(fù)制的不同點(diǎn)


chapter 10 RNA合成
一、合成以原核生物為例,加工則是指真核生物
1、RNA聚合物附著到啟動(dòng)子上,需要很多轉(zhuǎn)錄固子。
2、轉(zhuǎn)錄為不對(duì)稱(chēng)轉(zhuǎn)錄,合成方向5端-3端,3、模板DNA
4、主要E是DNA指導(dǎo)的RN聚合E,5、原料NTP,6、產(chǎn)物:RNA
7、不需要引物
考點(diǎn):RNA聚合E的組成,復(fù)制轉(zhuǎn)錄的區(qū)別
真核生物的DNA序列特點(diǎn)
二、MRNA的加工
1、加工方式加帽,加尾,轉(zhuǎn)錄后加上去
2、剪接過(guò)程,兩次剪接過(guò)程,把內(nèi)合子去掉,把外顯子連接起來(lái)。
例:內(nèi)合子通過(guò)剪接過(guò)程去掉
3、編輯作用:在RNA序列中插入或刪除核甘酸,第二次遺傳信息修正(TRNA涉及到堿基的修飾)。


Chapter 11 蛋白質(zhì)合成
一、三種RNA的作用
1、MRNA作為模板,從AUG開(kāi)始每3個(gè)核甘酸組成一個(gè)密碼,密碼子特點(diǎn):(1)起始密碼子,AUG,代表了翻譯起始,又代表蛋aa,開(kāi)放讀碼框架。
UAA、UAG、UGA為三個(gè)終止密碼子,不代表任何aa,(2)連續(xù)性:插入或缺失造成“讀碼框架移位”(3)簡(jiǎn)并性:密碼子上第三個(gè)堿基致變不影響aa的翻譯。Aa:UUG、UUA、UUC、UUU,(4)通用性:從原核生物到人類(lèi)同一套密碼(5)擺動(dòng)性,常由于密碼子第三位堿基對(duì)反密碼子第一位堿基,最常見(jiàn)的是黃嘌吟I。
2、TRNA: 氨酸酰-tRNA合成E
密碼子是GGC,那么識(shí)別它的TRNA上的反密碼子GCC(方向)搖擺配對(duì):反密碼子第一位的堿基和密碼子第三位堿基配對(duì)時(shí)常不是嚴(yán)格按照堿基外酸對(duì)原則,I(次黃嘌呤)
3、RRNA作用:作用與PR結(jié)合在一 起,為PR合成提供場(chǎng)所。(了解)
二、合成需要注意點(diǎn):(原核生物與真核生物PR合成的異同點(diǎn))
1、模板:MRNA 2、方向:N斷→C端 3、主要的酶和參與因子,起始固子,延長(zhǎng)固子,終止因子,原核與真核區(qū)別,主要的E為轉(zhuǎn)肽E,位于大亞基的間立上。催化肽鍵形成,催化3’5’-磷酸二酯鍵的形成,DNA(RNA)聚合酶未催化4、原料:aa 5、產(chǎn)物:多肽鏈6、由GTP提供能量,耗能的過(guò)錯(cuò)
三、Pr合成后的加工(一)高級(jí)結(jié)構(gòu):
1、亞基的聚合:白紅蛋白兩個(gè)亞基αβ-亞基以非共價(jià)鍵聚合
2、輔基的連接:與輔基結(jié)合后才有語(yǔ)性。
一級(jí)結(jié)構(gòu):(1)去掉N端蛋AA,(2)個(gè)別aa的修飾作用:堿基修飾,羥脯AA,羥賴(lài)AA (3)水解修飾作用:水解一個(gè)肽段才有活性。
例:哪些屬于PR加工過(guò)程,(如亞基聚合,aa修飾作用)
四、分泌pr 核蛋白體,常依于粗面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上,合成之后,把信號(hào)肽水解掉后,成熟到高爾基體分泌出去。
五、PR合成的干擾和抑制
干擾素對(duì)病毒作用機(jī)制:課本P290,兩方向的作用
考大題:(1)比較DNA復(fù)制,RNA合成,PR合成的異同點(diǎn)
(2)原核,單核生物合成PR的異同點(diǎn)


chapter 12 基因表達(dá)的調(diào)控
一、基因表達(dá):一個(gè)細(xì)胞或病毒所攜帶的全部遺傳信息或整套基因
即基因組,基因表達(dá)就是基因轉(zhuǎn)錄和翻譯的過(guò)程,并非所有基因
表達(dá)都產(chǎn)生PR,rRNA和tRNA合成DNA也是基因表達(dá),剪接體表達(dá)
例r、多肽鍵、rRNA屬于,糖脂合成不是
1、特點(diǎn):(1)時(shí)間特異性:指基因表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序開(kāi)啟或關(guān)閉。例甲胎蛋白基因在胎兒表達(dá),出生后關(guān)閉,又稱(chēng)階段特異性。(2)空間特異性,指多細(xì)胞生物,同一基因在不同的組織器官表達(dá)多少不同,或因一生長(zhǎng)階段,不同的基歷表達(dá)產(chǎn)物在不同組織器官分布也不相同,也稱(chēng)組織特異性,如腎臟合成EPO,肝臟合成酮體的特異性
各器官的MRNA,CDNA都不同
2、表達(dá)方式:(1)組成性表達(dá),某個(gè)基因的表達(dá)對(duì)其生命很重要,持續(xù)表達(dá),很少受環(huán)境影響,稱(chēng)為管家基因。特點(diǎn):(1)細(xì)胞生命注動(dòng)所必需要(2)很少受外界環(huán)境影響而改變,波動(dòng)很。3)幾乎在所有的組織細(xì)胞內(nèi)或發(fā)育階段均表達(dá)。(2)與管家基因相對(duì)的基因,奢侈基因,(1)不是必需(2)受外界環(huán)境影響很大,表達(dá)增高時(shí),稱(chēng)為可誘導(dǎo)的,反之,是不可遏制的.(3)不是所有的細(xì)胞或階段均表達(dá),決定了不同器官組織的特異性(誘導(dǎo)Gene 遏制 Gene)
考點(diǎn):(1)什么是時(shí)間特異性,空間特異性,(2)管家基因的描述
二、基因表達(dá)調(diào)控
(一)基本原理:1、基本要素:(1)特異性DNA的調(diào)節(jié)序列,指對(duì)基因的轉(zhuǎn)錄具有調(diào)節(jié)作用的一類(lèi)特殊DNA序列,自身并不轉(zhuǎn)錄
人為改變這一致序列,會(huì)使整條DNA序列功能喪失,常為轉(zhuǎn)錄因子的錨點(diǎn),即結(jié)合依點(diǎn)。
順式作用元件:在直核生物內(nèi),對(duì)自身基因有調(diào)節(jié)作用的DNA序列,對(duì)基因的調(diào)控至關(guān)重要,(2)調(diào)節(jié)蛋白/轉(zhuǎn)錄因子:指對(duì)Gene 轉(zhuǎn)錄有調(diào)節(jié)作用的一類(lèi)特殊蛋白質(zhì).搭橋R與PR結(jié)合
轉(zhuǎn)錄因子的進(jìn)一步定義:通過(guò)PR與基因作用或PR相互作用對(duì)轉(zhuǎn)錄進(jìn)行調(diào)節(jié)的特殊蛋白質(zhì)。
(3)通過(guò)對(duì)RNA聚合酶的活性進(jìn)行調(diào)節(jié)來(lái)體現(xiàn)順式作用與轉(zhuǎn)錄因子的作用TFIID與TATA-box結(jié)合。
DNA調(diào)節(jié)序列即不轉(zhuǎn)錄也不翻譯,內(nèi)合子轉(zhuǎn)錄但不翻譯,外顯子既轉(zhuǎn)錄翻譯
只有肝臟才有與無(wú)件結(jié)合的RNA的聚合酶
轉(zhuǎn)錄因子是基因表達(dá)多樣性的源泉,或者說(shuō),它在基因表達(dá)中主導(dǎo)作用.
反式作用因子-機(jī)體內(nèi)大多數(shù)以反式作用因子調(diào)節(jié)為主要方式
三、原核生物中基因轉(zhuǎn)錄特點(diǎn):(1)決定RNA聚合酶識(shí)別特異的是θ因子;(2)操縱子來(lái)實(shí)現(xiàn)基因轉(zhuǎn)錄
操縱子-幾個(gè)功能相同的基因串聯(lián)成族,受同一調(diào)節(jié)機(jī)制調(diào)節(jié)的結(jié)構(gòu);多順?lè)醋?包括2個(gè)(含以上)編碼
(3)以負(fù)性調(diào)節(jié)點(diǎn)占主導(dǎo),以乳糖操縱子為例
阻遏Pr和操縱序列結(jié)合阻遏RNA聚合E的結(jié)合,稱(chēng)為負(fù)性調(diào)節(jié).
少量的 半乳糖+阻遏Pr→阻遏Pr變構(gòu)脫落→轉(zhuǎn)錄開(kāi)始
考點(diǎn):(1)阻遇PR結(jié)合操縱序列,RNA聚合和啟動(dòng)序列結(jié)合
(2)原核生物轉(zhuǎn)錄出的是多順?lè)醋樱?)以負(fù)性調(diào)節(jié)為主導(dǎo)。
大題:以乳糖操作子為例,說(shuō)明原核生物基因轉(zhuǎn)錄原理
四、真核生物中的基因轉(zhuǎn)錄:
(1)基因組織構(gòu)的特點(diǎn):龐大(2)為單順?lè)醋咏Y(jié)構(gòu)(3)重復(fù)序列,一般序列在基因組織多次重復(fù)(4)基因的不連續(xù)性。
(2)表達(dá)調(diào)控制特點(diǎn):(1)RNA聚合E不同(2)基因轉(zhuǎn)錄必須有染色質(zhì)活化
a、凡是活化的染色質(zhì)對(duì)核酸酶高度敏感,b、DNA拓補(bǔ)結(jié)構(gòu)變化,c、DNA堿基修飾變化,(3)轉(zhuǎn)錄活躍的甲基化水平低,不轉(zhuǎn)錄的甲基化水平高(4)組pr修飾增加,尤其是乙;。
(3)以正性調(diào)節(jié)占為主導(dǎo)。(4)轉(zhuǎn)錄和翻譯是分隔進(jìn)行的。(5)轉(zhuǎn)錄后修飾加工。
考題:原、真核生物基因轉(zhuǎn)錄的異同點(diǎn)
五、基因轉(zhuǎn)錄激語(yǔ)的調(diào)節(jié):
(一)順式作用元件;啟動(dòng)子+增強(qiáng)子+沉默子
啟動(dòng)子的特點(diǎn):(1)轉(zhuǎn)錄所必需(2)常低于基因的5’側(cè)翼(3)近距離作用(4)右方向性
增強(qiáng)子的特點(diǎn):(1)使用轉(zhuǎn)錄活性增高,但不是轉(zhuǎn)錄必需(2)可低于基因的上中下游(3)可近可遠(yuǎn)的調(diào)節(jié)(4)對(duì)基因轉(zhuǎn)無(wú)方向性(5)作用必經(jīng)啟動(dòng)子起作用(6)具有組織器官特異性(與之結(jié)合的轉(zhuǎn)錄固子)
3、沉默子的特點(diǎn)與增強(qiáng)子增強(qiáng)相似,但它使轉(zhuǎn)錄活性下降

 

Chapter13 基因舊重組與基因工程
一、基因舊重組技術(shù)
(一)概念
(二)方法:1、化學(xué)合成法,2、CDNA 3、基因組 4、PCR最快捷方便獲得目的基因
(1)PCR原理,(2)PCR一個(gè)循環(huán)由變性-退火-延伸組成,(3)Tag酶耐熱
(4)退火溫度取決于引物的Tm值
大題:PCR原理及在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用
(三)載體:質(zhì)粒DNA,病毒DNA(腺病毒遞轉(zhuǎn)錄病毒),噬菌體DNA人工載體,真核生物不能作用于載體(比如昆蟲(chóng))
(四)DNA重組里需要的酶要記
1、限制性的內(nèi)切酶:是有識(shí)別DNA的特異序列,并在識(shí)別位點(diǎn)或其周?chē)懈铍p鏈DNA的一類(lèi)內(nèi)切酶
它識(shí)別的是雙鏈DNA(2)需要特別序識(shí)別(3)核酸內(nèi)切酶
2、識(shí)別序列特點(diǎn):回文結(jié)構(gòu)
原核生物里來(lái)的
通過(guò)DNA連接酶連接起來(lái)的,(DNA復(fù)制損傷修復(fù))
質(zhì)粒-倒入-大腸桿菌里稱(chēng)為轉(zhuǎn)化,質(zhì)粒倒入真核細(xì)胞稱(chēng)轉(zhuǎn)染
質(zhì)粒-倒入縮主C里稱(chēng)為感染
倒入后的篩選通過(guò)分子雜交實(shí)驗(yàn)(最直接的方法)
DNA重組技術(shù)的基本原理、過(guò)程、醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用
細(xì)胞信息傳遞
通過(guò)肌PR的傳導(dǎo)途徑(通路)
肌PR的特點(diǎn)
腎上腺毒調(diào)節(jié)糖原的通路
AMP激火PKA CGMP激活PKG
Ca2+ 與鈣調(diào)PR結(jié)合對(duì)C進(jìn)行調(diào)節(jié),以下酶類(lèi)要看
細(xì)胞核受體的特點(diǎn):
1、配體常是脂溶性的 2、本身就是一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子
血液的生物化學(xué)
一、非蛋白氮:非PR類(lèi)氮化合物,主要有尿素、肌酸、肝酐、尿酸、膽紅素和NH3,它們中的氮總稱(chēng)為非蛋白氮(NPN)
其中白尿素(BUN)約占NPN的1/2,最為重要,
RBC代謝的特點(diǎn),2、2、3一二磷的甘油酸旁路的定義、生理意義?3、血紅素的生
成:(1)原料(2)合成的關(guān)鍵E:NADH合酶
4、肝的生物轉(zhuǎn)化作用:(1)生物轉(zhuǎn)化定義、類(lèi)型(氧化還原水解、還原最重要)
氧化酶的概念和組成特點(diǎn)(在氧化還原反中)(3)生物轉(zhuǎn)化中最重要的結(jié)反應(yīng)是葡萄糖醛酸結(jié)合。
葡萄糖醛酸的供體是:UDPGA
5、初/次級(jí)膽汁酸的定義,由膽固醇和7-2羥化酶轉(zhuǎn)變而形成膽汁酸。
6、膽汁酸的功能:
7、膽色素代謝中膽紅素重點(diǎn):(1)直接膽紅素與間接膽紅素的區(qū)別及定義
(2)肝內(nèi)與膽紅素運(yùn)輸相關(guān)的蛋白:Y蛋白、Z蛋白(缺少導(dǎo)致新生兒黃疸)
8、各種黃疸的區(qū)別?Vit不用看
癌在因,抑癌基因與生長(zhǎng)因子
1、癌基因的特點(diǎn):(1)存在于正常C(2)對(duì)C的生長(zhǎng)和分化有調(diào)節(jié)作用,(3)產(chǎn)物遍布全身各個(gè)角落(4)反常定表達(dá)會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞癌變
2、抑癌基因:(1)存在于正常C(2)對(duì)C的生長(zhǎng)、分化、也有調(diào)節(jié)作用(3)缺失會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞癌變(4)在腫瘤C里把此基因倒入也抑制腫瘤生長(zhǎng),這種基因叫做抑癌基因
3、生長(zhǎng)因子:對(duì)C生長(zhǎng)和分化具有調(diào)節(jié)作用的一類(lèi)小肽物質(zhì)
4、基因的定義和程序?

注意:生化筆記不全,希望大家能夠幫補(bǔ)上。歡迎到論壇交流。

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