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您現(xiàn)在的位置: 醫(yī)學(xué)全在線 > 理論教學(xué) > 基礎(chǔ)學(xué)科 > 生物化學(xué)與分子生物學(xué) > 正文:基因診斷(Gene Diagmosis)
    

基因診斷

  醫(yī)生需要綜合患者的病史,癥狀,及各種檢查的結(jié)果作出臨床診斷。隨著人們對(duì)疾病的病因及發(fā)病機(jī)理的認(rèn)識(shí)的不斷深入,臨床檢查的手段也在不斷進(jìn)步。目前看來,絕大多數(shù)疾病的發(fā)生,發(fā)展都與患者遺傳背景或者其改變有關(guān),所以臨床上越來越有必要檢查這種變化。這種用分子生物學(xué)方法檢測(cè)患者體內(nèi)遺傳物質(zhì)的水平或結(jié)構(gòu)變化而作出的或輔助臨床診斷的技術(shù),稱為基因診斷。

  一、基因診斷的對(duì)象

  1、病原生物的侵入:一般侵入體內(nèi)的病原生物可通過顯微鏡檢查各免疫學(xué)方法進(jìn)行診斷。但是,直接檢測(cè)病原生物的遺傳物質(zhì)可以大大提高診斷的敏感性。而肝在無法得到商業(yè)化抗體時(shí),基因診斷就成為檢測(cè)病原微生物感染,尤其是病毒感染的唯一手段。此外,由于基因堿基配對(duì)原理的基因診斷可直接檢測(cè)病原微生物的遺傳物質(zhì),所以診斷的特異性也大為提高。目前,基因診斷已在病毒性肝炎,受滋病等傳染病的診斷中發(fā)揮了不可代替的作用。

  2、先天遺傳性疾患:已有多種傳統(tǒng)的遺傳性疾患的發(fā)病原因被確定為特定基因的突變。例如:苯丙氨酸羥化酶基因突變可引起苯丙酮尿癥:腺苷脫胺酶基因突變可引起重癥聯(lián)合免疫缺陷癥(SCID);而淋巴細(xì)胞表面分子CD40或其配體(CD40L)基因突變則可引起無丙種球蛋白血癥。這類疾病的診斷除了仔細(xì)分析臨床癥狀及生化檢查結(jié)果外,從病因角度作出診斷則需要用基因診斷的方法檢測(cè)其基因突變的發(fā)生。此外,有些病因尚不清楚的疾病,如高血壓、自身免疫性疾病等,都可能與某個(gè)或某些遺傳位點(diǎn)的持有或改變有并。用基因診斷的方法檢測(cè)這些位點(diǎn)的改變,不僅對(duì)臨床診斷,而且對(duì)疾病的病因和發(fā)病機(jī)理的研究都具有重要的意義

  3、后天基因突變引起的疾。哼@方面最典型的例子就是腫瘤。雖然腫瘤的發(fā)病機(jī)理尚未完全明了,但人們可以初步認(rèn)為腫瘤的發(fā)生是由于個(gè)別細(xì)胞基因突變而引起的細(xì)胞無限增殖。無論是抑癌基因發(fā)生突變還是癌基因發(fā)生突變,如果確定這些改變的發(fā)生,都必須進(jìn)行基因診斷。

  4、其它:如DNA指紋、個(gè)體識(shí)別,親子關(guān)系識(shí)別,法醫(yī)物證等。

   二、基因診斷的方法

  與疾病相關(guān)的遺傳背景改變主要有兩類,一是遺傳物質(zhì),即DNA或RNA的水平的變化。例如病毒感染量病毒基因及其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物在人體內(nèi)的從無到有,某些腫瘤中癌基因表達(dá)水平的從低到高。二是遺傳物質(zhì)的結(jié)構(gòu)變化,即基因突變,如點(diǎn)突變引起的基因失活,及染色體轉(zhuǎn)位引起的基因激活或滅活等等。所以從理論上說所有檢測(cè)基因水平或結(jié)構(gòu)的方法都應(yīng)可用于基因診斷。但如考慮其臨床適用性,靈敏度等問題,下列幾種方法可看作是有應(yīng)用前景的基因診斷的方法。

  1、核酸雜交:酸雜交是從核酸分子混合液中檢測(cè)特定大小的核酸分子的傳統(tǒng)方法。其原理是核酸變性和復(fù)性理論。即雙鏈的核酸分子在某些理化因素作用下雙鏈解開,而在條件恢復(fù)后又可依堿基配對(duì)規(guī)律形成雙邊結(jié)構(gòu)。雜交通常在一支持膜上進(jìn)行,因此又稱為核酸印跡雜交。根據(jù)檢測(cè)樣品的不同又被分為DNA印跡交(Southern blot hybridization )和RNA印跡雜交(Northern blot hybridization)。其基本過程包括下列幾個(gè)步驟。

  (1)制備樣品:首先需要從待檢測(cè)組織樣品提取DNA或RNA。DNA應(yīng)先用限制性內(nèi)切酶消化以產(chǎn)生特定長度的片段,然后通過凝膠電泳將消化產(chǎn)物按分子大小進(jìn)行分離。一般來說DNA分子有其獨(dú)特的限制性內(nèi)切酶圖譜,所以經(jīng)酶切消化和電泳分離后可在凝膠上形成特定的區(qū)帶。再將含有DNA片段的凝膠進(jìn)行變性處理后,直接轉(zhuǎn)印到支持膜上并使其牢固結(jié)合。這樣等檢測(cè)片段在凝膠上的位置就直接反映在了轉(zhuǎn)印在膜上。RNA樣品則可直接在變性條件下電泳分離,然后轉(zhuǎn)印并交聯(lián)固定。

 。2)制備探針:探針是指一段能和待檢測(cè)核酸分子依堿基配對(duì)原則而結(jié)合的核酸片段。它可以是一段DNA、RNA或合成的寡核苷酸。在核酸雜交實(shí)驗(yàn)中,探針需要被標(biāo)記上可直接檢測(cè)的元素或分子。這樣,通過檢疫與恩印膜上的核酸分子結(jié)合上的探針分子,既可知道被檢測(cè)的核酸片段在膜上的位置,也就是在電泳凝膠上的位置,也就知道了它的分子大小。醫(yī)學(xué)線網(wǎng)站www.med126.com

 。3)雜交:首先要進(jìn)行預(yù)雜交,即用非特異的核酸溶液封閉膜上的非特異性結(jié)合位點(diǎn)。由于轉(zhuǎn)印在膜上的核酸分子已經(jīng)是變性的分子,所以雜交過程中只需變性標(biāo)記好的探針,再讓探針與膜在特定的溫度下反應(yīng),然后洗去未結(jié)合的探針分子即可。

 。4)檢測(cè):檢測(cè)的方法依標(biāo)記探針的方法而異。用放射性同位素標(biāo)記的探針需要用放射自顯影來檢測(cè)其在膜上的位置;而如果是用生物素等非同位素方法標(biāo)記的探針則需要用相應(yīng)的免疫組織化學(xué)的方法進(jìn)行檢測(cè)。

  2、聚合酶鏈反應(yīng):核酸雜交反應(yīng)是一對(duì)一的反應(yīng),即膜上有一個(gè)被檢測(cè)分子時(shí),相應(yīng)就有一個(gè)標(biāo)記的探針分子與它雜交。所以整個(gè)實(shí)驗(yàn)敏感性主要取決于標(biāo)記探針的質(zhì)量和雜交后的檢測(cè)方法。在優(yōu)化的條件下,核酸雜交可檢測(cè)到pg水平的靶分子,約相當(dāng)于106個(gè)分子。但是,在許多臨床情況下,即無法得到這樣的品量。這時(shí)可以用聚合酶鏈反應(yīng)來擴(kuò)增靶分子以特異性地增加靶分子量,達(dá)到提高敏感性的目的。

  聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction ,PCR)的反應(yīng)本身是在同一試管內(nèi)利用DNA聚合酶催化的反應(yīng)反復(fù)進(jìn)行同一段DNA片段的合成(圖23-1)。聚合酶反應(yīng)的模板是待檢測(cè)核酸分子:DNA可直接用于反應(yīng),而RNA則需要用反轉(zhuǎn)錄酶反轉(zhuǎn)錄成為cDNA,然后用作聚合酶反應(yīng)的模板。反應(yīng)的引物有兩條,分別位于待擴(kuò)增DNA片段的兩端,可啟動(dòng)相對(duì)方向的DNA合成。這樣從一個(gè)模板分子起始的話,經(jīng)過n次聚合酶反應(yīng)后就可以合成2n個(gè)模板分子。假如進(jìn)行了30輪反應(yīng),則可從一個(gè)待檢分子合成出230,即約109個(gè)待檢分子。對(duì)于一段500堿基對(duì)的DNA片段來說,這大約等于1ng的DNA。所以從很小時(shí)的樣品即有可能擴(kuò)增出電泳后肉眼可見的產(chǎn)物。

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