公開(公告)號(hào)
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CN1683559A
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公開(公告)日
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2005.10.19
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申請(qǐng)(專利)號(hào)
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CN200510024103.2
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申請(qǐng)日期
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2005.02.28
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專利名稱
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精神分裂癥相關(guān)基因TTR的多態(tài)性位點(diǎn)及其應(yīng)用
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主分類號(hào)
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C12Q1/68
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分類號(hào)
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C12Q1/68
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分案原申請(qǐng)?zhí)? |
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優(yōu)先權(quán)
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申請(qǐng)(專利權(quán))人
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上海交通大學(xué)
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發(fā)明(設(shè)計(jì))人
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賀林;楊異鳳;萬(wàn)春玲;馮國(guó)鄞
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地址
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200240上海市閔行區(qū)東川路800號(hào)
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頒證日
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國(guó)際申請(qǐng)
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進(jìn)入國(guó)家日期
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專利代理機(jī)構(gòu)
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上海交達(dá)專利事務(wù)所
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代理人
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毛翠瑩
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國(guó)省代碼
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上海;31
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主權(quán)項(xiàng)
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一種檢測(cè)轉(zhuǎn)甲狀腺蛋白TTR基因多態(tài)性位點(diǎn)的方法,其特征在于包括如下步驟:1)用常規(guī)酚氯仿方法從人的血液中提取DNA,濃度校正至10ng/μl,作為DNA模板;2)設(shè)計(jì)寡核苷酸引物序列,用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增,反應(yīng)體系為15μl,其中20μM正/反向引物0.3μl,2mM脫氧核苷酸1.5μl,含20mM鎂離子的緩沖液1.5μl,DNA聚合酶0.15μl及DNA模板1.0μl和滅菌雙蒸水10.25μl,退火溫度為53度,退火時(shí)間為1分鐘,擴(kuò)增32個(gè)循環(huán),得到TTR基因外顯子區(qū)域的DNA序列;3)對(duì)擴(kuò)增后得到的DNA序列進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序反應(yīng)總反應(yīng)體積5μl,PEABI的BigDye3.1熒光標(biāo)記的終止底物循環(huán)測(cè)序試劑混合物1μl,200ng基因組DNA,3.3pmol引物,循環(huán)參數(shù):96℃,30s;50℃,30s;60℃,1min;循環(huán)30次,產(chǎn)物經(jīng)乙酸鈉/乙醇純化后在DNA測(cè)序儀中進(jìn)行自動(dòng)測(cè)序,找出TTR基因外顯子區(qū)域所有潛在的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)。
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摘要
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本發(fā)明公開了一種與精神分裂癥相關(guān)的基因TTR及其新發(fā)現(xiàn)的多態(tài)性位點(diǎn),以及在檢測(cè)精神分裂癥方面的用途。本發(fā)明還提供了一種檢測(cè)TTR基因的單核苷酸多態(tài)性的方法,并用上述方法在TTR基因的SEQ ID NO:1所示序列的第293位,SEQ ID NO:2所示序列的第224位、第265位、第322位和第352位檢測(cè)到了四個(gè)新的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)和一個(gè)9核苷酸缺失的位點(diǎn)。其中,位于第二號(hào)外顯子293位的SNP1T→A的突變會(huì)造成氨基酸序列由谷氨酸到纈氨酸的改變,引起蛋白結(jié)構(gòu)和功能的變化,等位位點(diǎn)A,即在其DNA互補(bǔ)鏈上為T等位位點(diǎn),是產(chǎn)生精神分裂癥的一個(gè)危險(xiǎn)等位位點(diǎn),其可應(yīng)用于精神分裂癥的診斷。
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國(guó)際公布
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