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基因大片段、單拷貝缺失檢測(cè)芯片及其應(yīng)用

公開(公告)號(hào) CN1483837A  
公開(公告)日 2004.03.24  
申請(qǐng)(專利)號(hào) CN03131741.3  
申請(qǐng)日期 2003.07.25  
專利名稱 基因大片段、單拷貝缺失檢測(cè)芯片及其應(yīng)用  
主分類號(hào) C12Q1/68  
分類號(hào) C12Q1/68  
分案原申請(qǐng)?zhí)?  
優(yōu)先權(quán)  
申請(qǐng)(專利權(quán))人 江蘇省腫瘤醫(yī)院  
發(fā)明(設(shè)計(jì))人 王亞平;張曉梅;李金田;吳曉柳  
地址 210009江蘇省南京市百子亭42號(hào)  
頒證日  
國(guó)際申請(qǐng)  
進(jìn)入國(guó)家日期  
專利代理機(jī)構(gòu) 南京蘇高專利事務(wù)所  
代理人 柏尚春  
國(guó)省代碼 江蘇;32  
主權(quán)項(xiàng) 一種基因大片段、單拷貝缺失檢測(cè)芯片,其特征在于:1)對(duì)于僅有單個(gè)候選基因的遺傳性疾病,選取不少于3個(gè)的檢測(cè)基因,其中一個(gè)為致病基因,其余為參照基因,以基因外顯子為單位,根據(jù)基因的基因組DNA結(jié)構(gòu),選擇外顯子中具有相近Tm值長(zhǎng)度為30~50個(gè)堿基的序列并合成探針;2)對(duì)于具有多個(gè)候選基因遺傳性疾病,選取不少于3個(gè)的疾病相關(guān)基因作為檢測(cè)基因,以基因外顯子為單位,互為參照,根據(jù)基因的基因組DNA結(jié)構(gòu),選擇外顯子中具有相近Tm值長(zhǎng)度為30~50個(gè)堿基的序列并合成探針。  
摘要 本發(fā)明公開了一種基因大片段、單拷貝缺失檢測(cè)芯片及其應(yīng)用,解決了現(xiàn)有技術(shù)中受技術(shù)方法或樣本通量限制而難以臨床常規(guī)開展遺傳性疾病的基因大片段缺失檢測(cè)的不足和相關(guān)基因檢出率不高的缺點(diǎn),提供一種樣本能量高、基因撿出率高的基因大片段、單拷貝缺失檢測(cè)芯片和檢測(cè)方法,其特征在于:選取檢測(cè)基因,以基因外顯子為單位,根據(jù)基因的基因組DNA結(jié)構(gòu),選擇外顯子中具有相近Tm值長(zhǎng)度為30~50個(gè)堿基的序列并合成探針;探針點(diǎn)樣固定于玻片,探針的分布符合統(tǒng)計(jì)量的要求;待檢DNA樣本酸化處理,制備成一定大小的DNA片段;待檢DNA樣本內(nèi)加引物低度擴(kuò)增,并標(biāo)記熒光;待檢DNA樣本與芯片雜交,專用軟件分析各雜交探針點(diǎn)熒光信號(hào),確定待檢DNA的目標(biāo)基因是否存在大片段缺失。  
國(guó)際公布  
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