復旦大學兒科學學科于1988年、2002和2007年被評為國家重點學科，1997年列入國家“211工程”重點學科，是國家首批碩士、博士學位授權(quán)點、臨床醫(yī)學博士后流動站。本學科形成以新生兒醫(yī)學、小兒外科學、小兒心血管病學和小兒傳染病學等為優(yōu)勢主攻方向的學科特色。是“加拿大/中國新生兒與圍產(chǎn)醫(yī)學國際培訓中心”和“衛(wèi)生部新生兒疾病重點實驗室”的依托單位。本學科新生兒專業(yè)和小兒外科專業(yè)分別為“上海市醫(yī)學重點學科”和“上海市小兒外科疑難重癥臨床醫(yī)學中心”，呼吸急救專業(yè)為“上海市領先專業(yè)”。
本學科先后擁有陳翠貞、劉湘云、金漢珍、金百祥、寧壽葆、朱啟镕等一批享譽全國的著名專家，近年來，擁有以桂永浩、王衛(wèi)平、孫波、肖現(xiàn)民等一支以中青年為主體、在國內(nèi)兒科學界占重要學術(shù)地位的學科隊伍。目前，本學科點是中華醫(yī)學會兒科分會主任委員、上海兒科學會主任委員和上海小兒外科學會主任委員單位、衛(wèi)生部兒科住院醫(yī)師培訓基地、衛(wèi)生部“十一五”規(guī)劃兒科學本科生教材和研究生教材主編單位�！秲嚎茖W》本科生課程被評為教育部國家級精品課程。多人擔任《PEDIATRIC RESEARCH》、《PEDIATRICS》、《中華兒科雜志》等國際和國內(nèi)重要學術(shù)期刊的主編、副主編和編委工作，主編《實用新生兒學》、《兒童保健學》、《現(xiàn)代實用兒科學》、《兒科感染病學》和《現(xiàn)代小兒腫瘤學》等數(shù)十部專業(yè)權(quán)威專著。目前承擔863、國家科技支撐計劃、國家自然科學基金等國家級重大項目31項，近五年，獲得省部級以上獎勵9項。
