安徽中醫(yī)學院是全國最早開辦中醫(yī)研究生教育的高校之一，1978年開始招收碩士研究生，1999年開始與復旦大學、北京中醫(yī)藥大學等聯合培養(yǎng)博士研究生；2008年，獲準成為推薦優(yōu)秀應屆本科畢業(yè)生免試攻讀碩士學位研究生的院校。學校是安徽省高校首批博士后崗位設置單位。2009年，學校以中醫(yī)學、中藥學為授權學科，中西醫(yī)結合、藥學學科為支撐學科成功申報并成為國家級新增博士學位授予立項建設單位，即將迎來國務院學位辦終期檢查驗收。
學校以博士點立項建設為帶動醫(yī)學全在線,搜集整,理m.payment-defi.com，強化重點學科內涵建設�，F有省部級以上重點學科30個，其中，國家中醫(yī)藥重點學科17 個，安徽省A類重點學科1 個，安徽省B類重點學科12個。
學校有4個一級學科具有碩士學位授予權，25個二級學科具有碩士學位授予權，2個專業(yè)碩士學位授權點。
面向“十二五”，學校遵循高等中醫(yī)藥教育發(fā)展規(guī)律，堅持以中醫(yī)、中藥、中西醫(yī)結合、藥學學科為主體，凸顯中醫(yī)藥特色和優(yōu)勢，同時積極發(fā)展中醫(yī)藥相關學科，形成醫(yī)、管、理、工、經、文多學科協調發(fā)展的學科體系。
