人乳頭瘤病毒基因分型檢測診斷芯片和制作方法及檢測方法

醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫中心藥學(xué)論壇

公開(公告)號 CN1687451A

公開(公告)日 2005.10.26

申請(專利)號 CN200510013318.4

申請日期 2005.04.13

專利名稱人乳頭瘤病毒基因分型檢測診斷芯片和制作方法及檢測方法

主分類號 C12Q1/68

分類號 C12Q1/68

分案原申請?zhí)?

優(yōu)先權(quán)

申請(專利權(quán))人天津市紫波高科技有限公司

發(fā)明(設(shè)計)人高英堂;方淑昌;杜智

地址 300170天津市河?xùn)|區(qū)津塘路83號

頒證日

國際申請

進(jìn)入國家日期

專利代理機構(gòu) 天津市三利專利商標(biāo)代理有限公司

代理人王義為

國省代碼天津;12

主權(quán)項

一種人乳頭瘤病毒基因分型檢測診斷芯片，其特征是芯片基質(zhì)上設(shè)置探針，包括識別所有HPV基因型的通用探針1個，HPV基因型特異探針15個，用于區(qū)分HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35、HPV39、HPV42、HPV43、HPV44、HPV45、HPV52、HPV56、HPV58共計15種基因型，探針在芯片上微陣列排列，至少5個以上坐標(biāo)點控制芯片的矩形點樣區(qū)域，以坐標(biāo)點控制芯片的矩形點樣區(qū)域和點樣方向，微陣列中一個角設(shè)置2個坐標(biāo)點，為點樣起始點，指示探針排列方向，微陣列的其他3個角上為1個坐標(biāo)點，微陣列的縱列至少3列以上，微陣列的橫行至少3行以上；每個HPV探針點樣1個以上，通用探針是所有HPV的共有序列，HPV6、HPV11、HPV16、HPV18、HPV31、HPV33、HPV35、HPV42、HPV43、HPV44、HPV45、HPV52、HPV56、HPV58代表15種基因型，“+”代表陽性質(zhì)控點，排列方式由通用探針到各型探針由小數(shù)到大數(shù)依次排列，再加上陰性和陽性質(zhì)控點，點陣數(shù)至少18點以上；PCR引物采用2對24條鏈的套式引物組合，其核苷酸序列如下表所示，

基因型

序列組成

上游外引物

6/11

5’GC(C/T)CAGGGACATAACAATGG3′

18/58

5’GCACA(G/A)GGTCATAACAATGG3′

39/45

5’GCCCAGGGCCA(T/C)AACAATGG3′

33/35/56

5’GCACAAGG(T/C)CATAATAATGG3′

31/42

5’GCTCA(G/A)GGACACAATAATGG3′

44/52/16

5’GC(G/A)CAGGGCCACAATAATGG3′

上游內(nèi)引物

6/11/18/31/33

5’TTTGTTACTGTGGTAGATAC3′

44/56

5’TTTGTTACTGT(T/A)GTAGATAC3′

35/58/42

5’TTTGTTAC(T/C)GT(A/G)GTTGATAC3′

5’TTTGTCACAGTTGTGGATAC3′

39/45

5’TTTGTTACTGT(A/T)GTGGACAC3′

5’TTTGTTACTGTTGTTGATAC3′

下游外引物

6/33/58

5’CGTCCCAAAGGA(T/A)ACTGATC3′

5’CGGCCCAACGGAAACTGATC3′

摘要

本發(fā)明是人乳頭瘤病毒基因分型檢測診斷芯片和制作方法及檢測方法。在芯片基質(zhì)上設(shè)置16種探針，探針在芯片上微陣列排列，包括通用探針1個，HPV型特異探針有15個，用于區(qū)分HPV基因型6、11、16、18、31、33、35、39、42、43、44、45、52、56、58等共計15種基因型，在特異探針末端加一段特定的聚核苷酸尾巴，將點好的芯片放在紫外交聯(lián)儀內(nèi)進(jìn)行照射5分鐘，使探針完全固定在芯片上，構(gòu)成檢測診斷芯片。PCR引物采用2對24條鏈的套式引物組合。本發(fā)明具有診斷準(zhǔn)確、快速、診斷方法簡單、特異性強、信息量高和易于推廣使用的特點，臨床應(yīng)用具有極大的經(jīng)濟(jì)效益和社會效益。

國際公布

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